东京海洋大学是日本唯一特化海洋研究与教育的国立大学。2003年(平成15年)10月由拥有120年以上历史的东京商船大学及东京水产大学合并而成、2004年4月开始以东京海洋大学名义招收本科生。旧东京商船大学长年涌现出了许多支撑日本商船队的水手和海员、与打下水产立国基础的旧东京水产大学一同、至今仍致力于海洋科学与工学专门领域的教育与研究、并以世界标准为目标。

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海洋技术科学技术研究科

海洋生命科学（水圈生物科学、生物资源学、海洋生物工学）、食品机能保全科学（食品品质设计学、保健食品科学）、海洋环境保全学（海洋生物学、水圈环境化学、环境系统科学、环境系统工学、国际环境文化学）、海洋管理政策学（海洋政策学、海洋利用管理学）、海洋系统工学（环境技术学、动力系统工学、海洋机械工学、海洋人工智能、海洋探查·利用工学）、食品流通安全管理

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